Кенигсберг имел особое значение для нацистской Германии, как столица Восточной Пруссии в историческом контексте, здесь был центр выдвинутого на восток укрепрайона с двумя десятками заводов, которые снабжали гарнизон оружием и техникой. Гитлер настаивал на длительной обороне города, рассчитывая на высокий моральный дух защитников крепости. В основном это были уроженцы Пруссии, для которых эти земли были родными, а весь уклад жизни был близок к военному. 

Соединения 3-го Белорусского фронта в ходе Восточно-Прусской наступательной операции подошли к Кенигсбергу уже в январе 1945 года, но штурм был начат лишь спустя три месяца. Ему предшествовала длительная осада, к апрелю 1945 года к штурму крепости были готовы от 106 до 187 тыс. человек, а также около 5,2 тыс. орудий и минометов, 538 танков и САУ, 2,4 тыс. самолетов.

Советские подразделения были разбиты на штурмовые отряды и группы. Численность отряда — от 350 до 400 человек. В его составе саперная рота, взвод огнеметчиков, рота танков или батарея самоходок, батарея 120-миллиметровых минометов, несколько крупнокалиберных орудий, при поддержке артиллерийских дивизионов. В составе группы, меньшей по численности, также саперы, огнеметчики, стрелки, артиллерия и танки. Войска тренировались днем и ночью, брали штурмом кварталы, улицы, отдельные дома в предместьях Кенигсберга, которые во многом были похожи на сам город. В течение четырех дней перед началом штурма артиллерия вела огонь по оборонительным сооружениям. Штурмовым группам предстояло преодолеть три кольца обороны. Первое — в 6–8 км от его центра — состояло из траншей, противотанкового рва, проволочных заграждений и минных полей. На этом кольце располагалось 12 основных фортов, построенных к 1882 году, с гарнизонами от 150 до 300 человек, имеющими от 12 до 20 артиллерийских орудий. Второе кольцо обороны проходило по окраинам города и состояло из каменных зданий, баррикад, огневых точек на перекрестках и минных заграждений. Третье кольцо, в центре города, состояло из 9 бастионов, башен и равелинов, сооруженных в XVII веке и перестроенных в 1843–1873 годах, траншей, баррикад.Обороной города руководил генерал Отто Ляш. Его назначили комендантом Кенигсбергской комендатуры 28 января 1945 года. По его приказу в самом центре города, недалеко от замка Кенигсберг, был построен бункер на глубине 7 м под землей. Сооружение длиной 42 м, шириной 15 м включало 21 помещение, было обеспечено электричеством, водой, системами канализации, подачи свежего воздуха и связи. Штаб разместился в нем в марте 1945 года, а вечером 9 апреля здесь был подписан приказ о капитуляции гарнизона. Но прежде была задача удерживать город как можно дольше. Штурм города продолжался четыре дня, последним организованным очагом обороны в Кенигсберге стал гарнизон из 500 человек башни "Дона", он капитулировал 10 апреля в 06:00 утра.

При штурме Кенигсберга погибли, по разным данным, от 7 до 7,5 тыс. советских солдат и офицеров. Самым известным в регионе местом захоронения советских воинов стал мемориальный ансамбль 1 200 воинам-гвардейцам 11-й гвардейской армии, павшим в боях за город. Первоначально мемориал назывался "Памятник героям Кенигсберга".